Texty
Filosofie
Tomáš Akvinský a kategorie času (1977)
Zčasovění utopie – More, Andreae, Komenský (1986)
Progresívní prvky v Komenského kritice sociniánů (1987)
Čas, dějinnost a Aurelius Augustinus (1991)
Postavení a ráz ontologie v díle Edith Steinové (1993)
Nepostradatelný myslitel a vychovatel J. L Fischer (1994)
J. L. Fischer a přítomnost filosofie (1996)
Descartes, ontologie a literatura (1996)
Prof. PhDr. Josef Ludvík Fischer (6. 11. 1894 – 17. 2. 1973) (1996)
Současný román a ontologie. Descartes a moderna v úvahách M. Kundery (1996)
Proklos o nesmrtelnosti světa (1999)
Jednota, mnohost a novoplatónské tradice (2001)
A. Réginald – jeden ze vzorů M. Habáně (2002)
Metoděj Habáň (1899–1984) a tomismus (2003)
Emanuel Rádl a (český) tomismus (2003)
Metoděj Habáň a tomismus olomouckých dominikánů (2005)
Fischerova hierarchie hodnot (2005).
Středověká filosofie a benediktinský svět (2006)
K obrazu člověka v De potentia Tomáše Akvinského (2009)
Věčný problém metafyziky (2012)
Řád jako ústřední idea západní civilizace (2014)
Evoluce, revoluce, reformace – tři klíčové ideje evropské civilizace (2015)
Disputované otázky O Boží moci (De potentia) Tomáše Akvinského (2015)
Úděl filosofa v magické Olomouci (2016)
Triadistika
Triády v myšlení a v tvorbě (1983)
Heuristická hodnota trichotomií (1985)
Vztah Východu a Západu ve světle triadistiky (1986)
Trinitární Komenský, Leibniz a osvícenství (1986)
Triadistika jako problém filosofie dějin –
preliminární perspektivy (1989)
Rehabilitace triadistiky (1999)
Jan Amos Komenský a trinitární nauka Aurelia Augustina (2007)
Křesťanství a ekumenismus
Zkušenosti s Katolickou tübingenskou školou. České perspektivy (1993)
K vývoji názoru na moderní umění u některých katolických teologů (1993)
Küngův zápas o nové duchovní paradigma (1998)
Světový étos, periodizace, postmoderna (2002)
Hans Küng a Joseph Ratzinger – Benedikt XVI. (2005)
Wilfred Cantwell Smith a vývoj ekumenických iniciativ Hanse Künga (2007)
Víra a náboženské vyznání u Wilfreda Cantwella Smithe (2008)
K životu a dílu Hanse Künga (2009)
Erasmus Rotterdamský a Hans Küng (2011)
K beatifikaci Karola Wojtyły – Jana Pavla II. (2011)
Hledají se nosiči pochodní (2011)
Ekumenický koncil jako osud (2012)
V Písku se vyjevilo leccos podstatného (2012)
Soluňští bratři a "public intellectual" (2013)
Český protestantismus očima M. C. Putny (2014)
Hans Küng dopsal své paměti (2014)
Globální dějiny lidstva a křesťanství (2015)
Křesťanství a povaha změny (2016)
Houellebecqovo Podvolení je více než román (2016)
Smysl teologie v dnešním světě (2018)
Různé
Vychodilovy překlady Pascala v olomouckém Komenském (K 300. výročí úmrtí Blaise Pascala) (1963)
Radoslav Kutra – Obrazy (1966)
Radoslav Kutra – Kresby 1967 – Zastavení (1967)
Tereziánská vysokoškolská reforma a olomoucký J. K. Reidinger (1974)
Projev na generální stávce v Olomouci na Horním náměstí 27. 11. 1989
Ludwig Wittgenstein a Olomouc (1993)
Básnicky bydlí člověk. Závěrečné slovo při Hölderlinově večeru v olomouckém Divadle hudby (1997)
Vladimír Neuwirth a jeho Apokalyptický deník (2001)
Zrada vzdělanců a "public intellectual"(2002)
Únor 1948 – sine ira et studio? (2008)
Ideje, principy a hodnoty Sociální demokracie (2009)
Spolu u tkalcovského stavu života (Bratru Pavlovi k sedmdesátým narozeninám) (2010)
Cosi z něj zářilo… (Vzpomínka na Václava Freie) (2011)
Hledání a klopýtání s Jiřím Němcem (2015)
Letní filosofická škola, její idea a její protagonisté v sázavském období (2020)
Velká část zde publikovaných textů vyšla ve dvou knihách sebraných spisů doc. PhDr. Karla Flosse:
Karel Floss: Hledání duše zítřka. 1. vyd. Brno: Centrum pro studium demokracie a kultury, 2012. 467 s. ISBN 978-80-7325-267-0.
Karel Floss: Dávné inspirace a nové výzvy. 1. vydání. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2019. 406 stran. ISBN 978-80-244-5545-7.
V roce 2011 vyšla kniha rozhovorů Sylvy Fischerové s Karlem Flosse pod názvem Bůh vždycky zatřese stavbou, která byla v roce 2012 Nadací českého literárního fondu oceněna Výroční cenou za literární tvorbu:
FISCHEROVÁ, Sylva a FLOSS, Karel. Bůh vždycky zatřese stavbou. Vyd. 1. V Praze: Vyšehrad, 2011. 267 s. ISBN 978-80-7429-136-4.